Afin de résister aux envahisseurs, Arles transforme ses murailles en forteresse.
Durant le Haut Moyen-Âge, la ville est ravagée par les guerres et les épidémies de peste. Devant les invasions sarrasines, les Arlésiens se réfugient derrière les murailles antiques de la cité. L’amphithéâtre est transformé en forteresse.
A la fin du Xe siècle, avec le retour de la paix et un meilleur climat de sécurité, la ville s’agrandit. De nouveaux quartiers apparaissent : le « vieux bourg », l’actuel quartier de La Roquette, le « bourg neuf » et la Cavalerie.
C’est au XIIe siècle que sont bâtis l’église St Trophime et les bâtiments canoniaux, autour d’un cloître. En plein essor économique, Arles accueille les pèlerins qui se dirigent  vers St Jacques de Compostelle par la via Tolosana, que l’on appelle également chemin d’Arles, ou voie d’Arles. La nécropole des Alyscamps est devenue un des plus grands cimetières chrétiens d’Occident.
Le paysage urbain ainsi dessiné jusqu’au XIIIe siècle avec une enceinte qui enserre la ville, ne subira pratiquement plus de modifications jusqu’à l’époque moderne. Au début du XVIe siècle, Arles avec ses 10 000 habitants, est la deuxième ville du Comté de Provence, derrière Marseille.

Monuments et musées : Horaires et tarifs